Kapasitas unit filtrasi minyak trafo dipilih dari volume minyak dan target waktu proses. Prinsipnya, minyak sebaiknya bersirkulasi minimal tiga sampai lima kali volume total agar bersih merata. Misalnya 30.000 liter dengan laju 3.000 liter per jam membutuhkan sekitar 10 jam per siklus. Pastikan pula tingkat kehalusan filter dan daya pemanas sesuai, serta pompa mampu bekerja stabil pada minyak yang kental saat dingin.